Si, se puede realizar la prueba durante la gestación, después de la semana 16. En ese caso el Ginecólogo realizara una toma de muestra (AMNIOCENTESIS), en donde extraera , bajo supervisión ecográfica, una pequeña cantidad de líquido amniótico el cual contiene células que han sido descamadas por el feto. A los padres del bebé madre y padre, se les toma la muestra cuando hagan entrega de la muestra de líquido amniótico para el estudio de la paternidad.
Además, existe la posibilidad de realizar prueba no invasiva en sangre materna en caso de ser materna de alto riesgo, esta prueba solo identifica paternidad no otras condiciones o alteraciones del embarazo.